אחת לתקופה , כתלות בשימוש במערכת , יש לבצע את שלבי התפעול הבאים :
ראשית יש לעצור את פעולת משאבת הסינון ולודא כי פעולתה לא תחל באופן אוטומטי כל זמן התהליך . יש להוריד את מפסק החשמל הראשי או לעצור את פעולת המשאבה באופן יזום.
יש להעביר את בורר מצב הסינון למצב שטיפה (Backwash) ולהפעיל את משאבת הסינון למשך מספר רגעים עד שהמים היוצאים מצינור העודפים יהיו צלולים.
יש לעצור את משאבת הסחרור ולאחר להעביר את בורר הפילטר למצב דחיסה (Rinse ) ולהפעיל את משאבת הסחרור למשך חצי דקה , פעולה זו דוחסת את החול/זכוכית במיכל הסינון לצורך המשך פעולת הסינון התקינה.
יש למלא חזרה מים במערכת עד לגובה 5 סמ מעל הגט הגבוה ביותר במערכות ספא ועד למרכז חלון הסינון במערכות סווים או בריכות.
יש לעצור את משאבת הסחרור ולאחר להעביר את בורר הפילטר למצב סינון ולאחר יש להפעיל חזרה את משאבת הסינון .
יש לודא כי סילון המים היוצא מהג׳טים הינו אחיד ורציף ואין אויר כלוא בצנרת במשאבה או בפילטר המונע את זרימת המים ויגרום לשריפת אלמנט החימום או למניעת סינון.
